Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD1Q13393 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms