Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDR1Q08345 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDR1Q08345 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms