Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIN1Q05586 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIN1Q05586 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms