Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSC2Q02487 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms