Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms