Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCQ00610 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms