Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC5Q00444 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms