Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB1P98172 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms