Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PITX1P78337 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PITX1P78337 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PITX1P78337 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms