Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB1AP62820 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms