Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2NP61088 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms