Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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