Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB25P57735 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB25P57735 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB25P57735 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB25P57735 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms