Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRISP1P54107 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRISP1P54107 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms