Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGDP52209 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGDP52209 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGDP52209 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGDP52209 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms