Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV1P50549 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms