Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP153P49790 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUP153P49790 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUP153P49790 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUP153P49790 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NUP153P49790 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUP153P49790 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms