Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms