Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms