Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RORAP35398 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORAP35398 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORAP35398 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms