Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP6P35125 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP6P35125 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP6P35125 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP6P35125 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP6P35125 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP6P35125 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP6P35125 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP6P35125 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms