Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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HOXD10P28358 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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