Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR2CP28335 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms