Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA4P25789 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms