Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms