Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms