Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPRZ1P23471 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRZ1P23471 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms