Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPREP23469 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PTPREP23469 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPREP23469 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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