Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRDP23468 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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