Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL1P22362 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL1P22362 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL1P22362 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms