Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCMT1P22061 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms