Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFNA1P20827 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms