Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL2P13500 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL2P13500 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms