Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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DEFA4P12838 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DEFA4P12838 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA4P12838 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA4P12838 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DEFA4P12838 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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