Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms