Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI1P08151 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GLI1P08151 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GLI1P08151 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms