Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA3O96018 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA3O96018 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APBA3O96018 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA3O96018 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APBA3O96018 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms