Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms