Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUSD5O60279 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUSD5O60279 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms