Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB3O43889 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB3O43889 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CREB3O43889 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms