Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HTRA2O43464 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms