Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GOLGA6L9A6NEM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms