Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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