Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PARP3Q9Y6F1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms