Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00312Q9Y6C7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms