Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLF12Q9Y4X4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLF12Q9Y4X4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms