Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NFE2L3Q9Y4A8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFE2L3Q9Y4A8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms