Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMED5Q9Y3A6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms