Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THSD7AQ9UPZ6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THSD7AQ9UPZ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms