Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms